Biomarqueurs
Dans le domaine des biomarqueurs, notre valeur ajoutée repose sur :
- l’intégration de l’expertise en matière de biomarqueurs depuis la phase de découverte jusqu’à la phase de développement,
- la collaboration avec des cliniciens et des leaders d’opinion clés dans les domaines thérapeutiques pertinents,
- un vaste portefeuille de tests de biomarqueurs, validés pour la recherche et le développement,
- développement technologique de test et d’analyse des données.
Les biomarqueurs jouent un rôle important dans le développement de la médecine personnalisée. Un biomarqueur unique ou une combinaison de marqueurs, définis comme des signatures, peuvent être liés à l’hôte ou à l’agent pathogène.
Ils peuvent être utilisés pour diagnostiquer des maladies, comme indicateurs de pronostic, pour le développement de thérapies individualisées, pour prédire ou traiter des effets indésirables des médicaments ou, encore, dans les études pharmacodynamiques et dose-réponse.
Pour répondre à vos besoins en matière de biomarqueurs en tant qu’outil de recherche ou translationnel, ou pour les tests compagnons/diagnostiques, nous proposons une approche itérative en plusieurs étapes qui associe un processus de sélection de biomarqueurs bien contrôlé à une technologie analytique adaptée. Cette approche permet d’élaborer une solide stratégie de développement des tests des biomarqueurs à toutes les phases, en assurant une maitrise les risques aux étapes clés de votre programme.
La découverte et la validation de biomarqueurs exigent une forte synergie multidisciplinaire entre nos scientifiques, nos partenaires cliniciens et nos analystes afin de garantir l’excellence scientifique au bénéfice pour votre projet. En outre, nous portons une attention particulière à concevoir une étude pertinente par une compréhension de votre besoin et par la définition du profil cible attendu selon l’application recherchée
Un processus en trois étapes est mis en place selon une approche ciblée (basée sur des hypothèses) ou non ciblée (basée sur la découverte) définie avec vous au début du programme.
Découverte de biomarqueurs
Objectif : identifier des biomarqueurs candidats en utilisant la
technologie OMICS.
Validation de biomarqueurs
& développement de technologies analytiques
Objectif : confirmer les biomarqueurs candidats dans une étude à part entière avec un dispositif analytique adapté.
Confirmation de la pertinence clinique des biomarqueurs
Objectif : démontrer la pertinence clinique des biomarqueurs dans une cohorte plus importante avec le dispositif bioanalytique le plus abouti (ou classé IVD).
Découverte de biomarqueurs
L’objectif de cette phase est d’identifier des biomarqueurs candidats dont l’expression est corrélée au mode d’action d’un médicament, à un changement physiopathologique dans une maladie, à la présence d’un pathogène, à l’évolution d’une thérapie ou au suivi d’une étude de sécurité ou d’efficacité d’un traitement.
Nos experts vous aideront à concevoir votre étude de manière personnalisée et à définir la technologie analytique la plus appropriée en tenant compte de plusieurs facteurs tels que i) la nature du biomarqueur (moléculaire, protéique, métabolites, lipides,…), ii) le type et l’origine des échantillons (humain vs animal ; tissus, organes, biofluides), qui auront un impact sur la méthode de préparation des échantillons, iii) l’application cible (développement de médicaments, compagnons ou diagnostics) ou encore iv) les utilisateurs finaux (tests de laboratoire vs au chevet du patient).
Nous fournissons un large portefeuille de technologies intégrées « OMICS » avec des protocoles éprouvés, depuis la préparation des échantillons jusqu’à l’analyse bioinformatique/biostatistique de données complexes et multi-sources, dans le domaine de la génomique, de la transcriptomique, de la protéomique et de la métabolomique. Nous explorons la biologie systémique qui peut améliorer les stratégies actuelles de découverte de biomarqueurs par l’extraction de nouvelles informations biologiques. Elle exploite des systèmes complexes et multigéniques en intégrant une approche computationnelle des données génétiques ainsi que des voies de signalisation moléculaire.
Validation des biomarqueurs et développement de technologies analytiques
Les biomarqueurs identifiés par une approche ciblée (fondée sur des hypothèses pré-existantes) ou non ciblée (fondée sur la découverte sans à priori) nécessitent une validation rigoureuse.
Nous vous aidons dans cette phase essentielle pour permettre une exploitation effective d’un biomarqueur dans une application clinique. Cette étape repose principalement sur la confirmation des marqueurs candidats dans une étude indépendante utilisant des spécimens humains ou des modèles animaux et la mise en œuvre de plateformes bioanalytiques validées et adaptées à l’étude. Selon la nature et le nombre de marqueurs étudiés, des plateformes de qPCR simple/multiplexe, de cytométrie de flux ou d’immunoessais multiplexés peuvent être utilisées. Des méthodes biostatistiques sont appliquées pour réduire l’ensemble des gènes d’intérêt et définir la signature finale ayant les meilleures performances diagnostiques.
Les dispositifs basés sur des microsystèmes peuvent être une technologie de choix pour valider la présence et/ou la pertinence d’un biomarqueur. À titre d’exemple, nous appliquons l’analyse unicellulaire du phénotype cellulaire basée sur des gouttelettes, qui offre une sensibilité et une résolution pour la validation des biomarqueurs que les méthodes actuelles globales ne permettent pas d’atteindre. La résolution unicellulaire peut révéler des mécanismes de résistance au traitement ou une réponse immunitaire anormale permettant de mieux stratifier les patients dans les essais cliniques.
Confirmation de la pertinence clinique des biomarqueurs
Sur le plan thérapeutique, nous vous aidons à démontrer la pertinence des biomarqueurs de substitution dans les études précliniques ou les premières phases cliniques afin de minimiser le nombre de patients, ainsi que le temps et les ressources, nécessaires aux études pivots.
D’un point de vue diagnostique, nous vous aidons à démontrer la pertinence et l’utilité cliniques des marqueurs, soit en tant que diagnostics compagnons, soit en tant que tests diagnostiques. Les biomarqueurs validés seront mesurés dans une plus grande cohorte avec le dispositif bioanalytique le plus avancé (ou classé IVD) qui peut être une plateforme moléculaire (par exemple, NGS, tests qPCR simplex ou multiplex), une plateforme de dosage immunologique automatisée de laboratoire ou un test de diagnostic rapide au chevet du patient.
Pour atteindre cet objectif, nous nous associons à un réseau clinique (hôpitaux, cliniques) pour accéder à des biospécimens humains bien caractérisés associés à des données cliniques et microbiologiques de haute qualité, issus d’études rétrospectives ou prospectives. Notre contribution dans la conduite d’études cliniques observationnelles et longitudinales inclut la rédaction des cahiers d’observation, des formulaires de consentement éclairé, des protocoles et des soumissions réglementaires en matière de bonnes pratiques cliniques et ce dans le cadre d’une certification de la norme ISO9001.
En savoir plus sur la technologie des opérations cliniques.
Validation des biomarqueurs et développement de technologies analytiques
Les biomarqueurs identifiés par une approche ciblée (fondée sur des hypothèses pré-existantes) ou non ciblée (fondée sur la découverte sans à priori) nécessitent une validation rigoureuse.
Nous vous aidons dans cette phase essentielle pour permettre une exploitation effective d’un biomarqueur dans une application clinique. Cette étape repose principalement sur la confirmation des marqueurs candidats dans une étude indépendante utilisant des spécimens humains ou des modèles animaux et la mise en œuvre de plateformes bioanalytiques validées et adaptées à l’étude. Selon la nature et le nombre de marqueurs étudiés, des plateformes de qPCR simple/multiplexe, de cytométrie de flux ou d’immunoessais multiplexés peuvent être utilisées. Des méthodes biostatistiques sont appliquées pour réduire l’ensemble des gènes d’intérêt et définir la signature finale ayant les meilleures performances diagnostiques.
Les dispositifs basés sur des microsystèmes peuvent être une technologie de choix pour valider la présence et/ou la pertinence d’un biomarqueur. À titre d’exemple, nous appliquons l’analyse unicellulaire du phénotype cellulaire basée sur des gouttelettes, qui offre une sensibilité et une résolution pour la validation des biomarqueurs que les méthodes actuelles globales ne permettent pas d’atteindre. La résolution unicellulaire peut révéler des mécanismes de résistance au traitement ou une réponse immunitaire anormale permettant de mieux stratifier les patients dans les essais cliniques.
Utilité des biomarqueurs dans le diagnostic, les diagnostics compagnons et pour en support au développement de vaccins et de médicaments/la recherche translationnelle :
| Diagnostic | Diagnostic d’accompagnement | Développement de vaccins/médicaments et à la recherche translationnelle |
|
|---|---|---|---|
| Utilité des biomarqueurs | Diagnostic, pronostic, suivi du traitement d’une maladie. Fortement recommandé pour une prescription sûre et une bonne pratique médicale. |
Sélection des bons patients. Associé à une thérapie ciblée (médecine personnalisée). Prédictif de l’issue du traitement Mode d’action d’un vaccin/médicament. |
Mode d’action du vaccin/médicament. Caractérisation de la physiopathologie. Outils translationnels. Évaluation de la sécurité/efficacité. |
| Technologie requise pour le développement | Plateformes de détection spécifiques basées sur les OMICS ou spécifiques aux biomarqueurs. | Plateformes de détection spécifiques. | Plateformes de détection spécifiques ou basées sur les OMICS. |
| Type de technologie pour l’analyse finale du biomarqueur | Tests au chevet du patient, tests de laboratoire. | Tests au chevet du patient, tests de laboratoire. | Tests en laboratoire. |
| Base réglementaire | Enregistrement réglementaire diagnostic In Vitro. | Co-enregistrement du test compagnon à une thérapie ciblée. | Sans objet. |