Relever les défis des sciences de la vie en matière de données
Maîtriser l’ensemble de la chaîne de valeur des données pour servir les enjeux d’intégration et d’analyse avancées des données des projets des sciences de la vie.
Les questions biologiques auxquelles il faut répondre nécessitent souvent la conception d’études (pré-)cliniques et la production de paramètres et de résultats multiples et variés, par exemple des données omiques.
Comment transformer une grande quantité de données complexes, hétérogènes et de haute dimension en connaissances exploitables ?
En maîtrisant l’ensemble de la valeur de la chaîne de données d’une manière totalement contrôlée, depuis la capture des données, l’analyse intégrative avancée des données jusqu’à la consolidation et au partage des connaissances.
Capture et collecte des données
Réaliser le premier niveau d’intégration des données/métadonnées à partir d’espèces et de spécimens divers et hétérogènes.
- Suivi et enregistrement précis des données sur la base de solutions de numérisation de laboratoire : LIMS pour les résultats, eCRF pour les paramètres cliniques, etc.
- En fonction de vos besoins, nous proposons des solutions d’entreposage de données génériques/centralisées jusqu’à la modélisation et la fusion plus profonde de relations (méta)données. Cela permet de mieux maîtriser la complexité des biospécimens et de la réconciliation des résultats provenant de différents sites cliniques, études (pré)cliniques, échantillonnages, points de prélèvement, etc.
- Nous procédons au traitement des données afin de les standardiser (utilisation d’une ontologie, d’un dictionnaire de données, etc.) et de les enrichir (interopérabilité avec la littérature et les bases de données biologiques de référence externes, etc.). Ces deux étapes sont cruciales avant tout processus d’analyse précise des données.
- Nous adoptons les principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable & Reusable) pour régir notre colonne vertébrale de gestion des données scientifiques.
- Comme BIOASTER propose une offre full-stack par nature, votre projet bénéficiera de la « continuité des données » depuis la collecte des échantillons, l’analyse en laboratoire jusqu’à la bioinformatique et les traitements statistiques avec à la fois des échantillons et des données gérés au même endroit ce qui renforce l’ensemble de la chaîne de valeur des données.
Voyez comment elle est appliquée dans nos études de cas : MOSAIC, GNA-Now, COVID-AuRA Translate
Analyse des données
Faites vôtre les dernières avancées en bioinformatique et en IA/ML pour relever les défis de l’analyse intégrative provenant de la biologie translationnelle, de la médecine de précision, de l’interaction hôte-pathogène ou de la biologie systémique.
- BIOASTER a développé une approche holistique, en rendant les données plus significatives grâce à un feed-back continu et vertueux entre les experts biologiques, les bioinformaticiens et les data scientists pour atteindre des résultats affinés.
Nous transformons, avec vous, les objectifs du projet en un ensemble de questions biologiques claires, limitées et sans ambiguïté à traiter.
- Nos cadres d’analyse sont capables de s’adapter à une grande diversité de projets, comme en témoigne l’expérience de BIOASTER : trouver des signatures moléculaires à partir d’expériences mono-omiques ou multi-omiques, identifier rapidement le microbiote dans des échantillons prélevés à différents moments, établir des corrélations d’événements (par exemple, local vs systémique ou tardif ou précoce pour identifier le mode d’action d’un adjuvant dans un projet de vaccinologie multi-espèces), stratifier les populations pour la médecine de précision (par exemple, mauvais/bons répondeurs), réduire les signatures pour des systèmes de diagnostic in vitro, etc.
- Nous explorons les connexions de données en choissiant les modèles statistiques les plus appropriés capables d’expliquer ou de prédire les réponses, en travaillant sur l’intégration complexe des données moléculaire et des paramètres cliniques.
- Nous vous faisons bénéficier de l’avantage cumulé du BigData et de l’Intelligence Artificielle (par exemple les algorithmes de Deep Learning) pour explorer de nouvelles associations de types de données (par exemple omiques, cytométrie, image, etc.) ainsi que des potentiels insoupçonnés en termes de gain de temps, de débit et d’amélioration de la sensibilité/spécificité.
Découvrez-en plus dans nos études de cas : MOSAIC, COVID-AuRA Translate
Collaboration en matière de données
Rendez les connaissances du projet exploitables tout en gardant le contrôle de sur les données.
- Nous vous fournissons une plateforme web de partage de données pour accéder aux données tout en assurant un contrôle d’accès strict basé sur les rôles et un transfert d’informations sécurisé.
- Nos clients ont accès à des outils avancés de visualisation de données dynamiques et à fort contenu, conçus pour réduire la complexité des données tout en favorisant l’interprétation des résultats.
- Nous concevons, prototypons et mettons également en œuvre des solutions numériques tout-en-un qui intègrent l’indexation des données brutes, des traitements bioinformatiques ou statistiques ainsi que des analyses visuelles pour la génération/test d’hypothèses et l’orientation de la prise de décision dans un contexte clinique.
- Les données et les connaissances sont mises en forme pour promouvoir une valorisation ultérieure (propriété intellectuelle, publication, licence, etc.).
Consultez notre étude de cas ici : Metagenomics
Biological
questions
Shape your biological questions of interest
Let’s design together the project to fit the best with your objectives
Data value chain
Take advantage of “same roof-made” continuity and Quality & Regulatory frameworks compliance both for readout production and data analytics
Benefit from the pluri-disciplinary interplay of a dedicated team of biologist experts, bioinformaticians, data scientists and data manager
Enter the “Full Stack Data Offer” at any moment
e.g. we can perform data analytics on your own dataset
Biological
outcomes
ASSETS
Make yours Biological Outcomes
Ready for sharing, valorization, long-term assets
Capture et collecte des données
Réaliser le premier niveau d’intégration des données/métadonnées à partir d’espèces et de spécimens divers et hétérogènes.
- Suivi et enregistrement précis des données sur la base de solutions de numérisation de laboratoire : LIMS pour les résultats, eCRF pour les paramètres cliniques, etc.
- En fonction de vos besoins, nous proposons des solutions d’entreposage de données génériques/centralisées jusqu’à la modélisation et la fusion plus profonde de relations (méta)données. Cela permet de mieux maîtriser la complexité des biospécimens et de la réconciliation des résultats provenant de différents sites cliniques, études (pré)cliniques, échantillonnages, points de prélèvement, etc.
- Nous procédons au traitement des données afin de les standardiser (utilisation d’une ontologie, d’un dictionnaire de données, etc.) et de les enrichir (interopérabilité avec la littérature et les bases de données biologiques de référence externes, etc.). Ces deux étapes sont cruciales avant tout processus d’analyse précise des données.
- Nous adoptons les principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable & Reusable) pour régir notre colonne vertébrale de gestion des données scientifiques.
- Comme BIOASTER propose une offre full-stack par nature, votre projet bénéficiera de la « continuité des données » depuis la collecte des échantillons, l’analyse en laboratoire jusqu’à la bioinformatique et les traitements statistiques avec à la fois des échantillons et des données gérés au même endroit ce qui renforce l’ensemble de la chaîne de valeur des données.
Voyez comment elle est appliquée dans nos études de cas : MOSAIC, GNA-Now, COVID-AuRA Translate
Analyse des données
Faites vôtre les dernières avancées en bioinformatique et en IA/ML pour relever les défis de l’analyse intégrative provenant de la biologie translationnelle, de la médecine de précision, de l’interaction hôte-pathogène ou de la biologie systémique.
- BIOASTER a développé une approche holistique, en rendant les données plus significatives grâce à un feed-back continu et vertueux entre les experts biologiques, les bioinformaticiens et les data scientists pour atteindre des résultats affinés.
Nous transformons, avec vous, les objectifs du projet en un ensemble de questions biologiques claires, limitées et sans ambiguïté à traiter.
- Nos cadres d’analyse sont capables de s’adapter à une grande diversité de projets, comme en témoigne l’expérience de BIOASTER : trouver des signatures moléculaires à partir d’expériences mono-omiques ou multi-omiques, identifier rapidement le microbiote dans des échantillons prélevés à différents moments, établir des corrélations d’événements (par exemple, local vs systémique ou tardif ou précoce pour identifier le mode d’action d’un adjuvant dans un projet de vaccinologie multi-espèces), stratifier les populations pour la médecine de précision (par exemple, mauvais/bons répondeurs), réduire les signatures pour des systèmes de diagnostic in vitro, etc.
- Nous explorons les connexions de données en choissiant les modèles statistiques les plus appropriés capables d’expliquer ou de prédire les réponses, en travaillant sur l’intégration complexe des données moléculaire et des paramètres cliniques.
- Nous vous faisons bénéficier de l’avantage cumulé du BigData et de l’Intelligence Artificielle (par exemple les algorithmes de Deep Learning) pour explorer de nouvelles associations de types de données (par exemple omiques, cytométrie, image, etc.) ainsi que des potentiels insoupçonnés en termes de gain de temps, de débit et d’amélioration de la sensibilité/spécificité.
Découvrez-en plus dans nos études de cas : MOSAIC, COVID-AuRA Translate
Collaboration en matière de données
Rendez les connaissances du projet exploitables tout en gardant le contrôle de sur les données.
- Nous vous fournissons une plateforme web de partage de données pour accéder aux données tout en assurant un contrôle d’accès strict basé sur les rôles et un transfert d’informations sécurisé.
- Nos clients ont accès à des outils avancés de visualisation de données dynamiques et à fort contenu, conçus pour réduire la complexité des données tout en favorisant l’interprétation des résultats.
- Nous concevons, prototypons et mettons également en œuvre des solutions numériques tout-en-un qui intègrent l’indexation des données brutes, des traitements bioinformatiques ou statistiques ainsi que des analyses visuelles pour la génération/test d’hypothèses et l’orientation de la prise de décision dans un contexte clinique.
- Les données et les connaissances sont mises en forme pour promouvoir une valorisation ultérieure (propriété intellectuelle, publication, licence, etc.).
Consultez notre étude de cas ici : Metagenomics